La médecine fonctionnelle a pour objectif thérapeutique la restauration des capacités d’un être à vivre ses facultés conscientes seules à même de créer les conditions physiologiques de la santé personnelle. Dans son application elle s’attachera à induire le processus biologique fonctionnel à l’origine de l’apparition et du développement des compétences promues par l’existence individuelle de l’être humain. Pour l’obtention d’une santé personnelle il faut définir une réalité qui soit caractéristique de l’existence personnelle de l’être humain. Il faut guérir une personne et non résoudre des problèmes pathologiques dont les réalités sont conditionnées par l’inconscient individuel dysfonctionnel.
Il est donc possible de comprendre la réalité d’une personne au travers de la complexité organisationnelle de sa forme d’existence est ainsi percevoir ce qui préfigure sa caractéristique principale soit la capacité de prendre conscience grâce aux moyens de l’information délivrés par la réalité individuelle. Seul un engagement conscient peut amener l’action nécessaire à la connaissance de ce qui fonde l’existence personnelle, et ainsi garantir la bonne santé du processus biologique fonctionnel créateur de réalité. La médecine fonctionnelle représente une approche fonctionnelle de l’être humain qui crée un acte thérapeutique dont le but est la restauration d’une santé personnelle qui soit conscience de la réalité de l’être.